El Nivel Secundario del Instituto Humboldt apunta a formar integralmente a los alumnos de tal manera que cuenten con las herramientas necesarias para enfrentar estudios superiores.
Las expectativas de logro están planteadas gradualmente a lo largo de sus seis años. Los alumnos asisten al colegio de 7:30 a 15:30 hs, tiempo en el que además de las áreas tradicionales aprenden Informática, Italiano, y Deportes.
La orientación de origen es la de «Humanidades y Ciencias Sociales» y que desde el año 2004 se ha ampliado en la formación de las Ciencias Exactas a fin de poder cumplir con el objetivo principal del nivel. Además incluye formación en Business English y cuenta con un espacio destinado a la Pasantía laboral para colaborar en la definición vocacional de los alumnos.
